Son trait distinctif est son cou massif, composé de vertèbres particulièrement lourdes et robustes, différent de celui d’autres sauropodes plus graciles comme Diplodocus. Cette puissance structurelle faisait d’Apatosaurus un géant trapu, probablement moins souple mais extrêmement imposant. Sa longue queue, effilée à l’extrémité, aurait pu claquer dans l’air comme un fouet sonore, peut-être pour se défendre contre des prédateurs ou communiquer avec ses congénères.